A partir de finalizada la segunda fase quedan nueve equipos de OFI en Copa Uruguay. Para la tercera ronda se suman 18 de Julio de Fray Bentos, campeón de la Copa B de OFI de la temporada anterior, y clubes de la Asociación Uruguaya de Fútbol (AUF). El cuadro final será sorteado y tendrá a 32 instituciones. El único representante salteño es Ferro Carril pero puede meterse Salto FC.